3 前列腺内尿液返流
1980年，Ramirez 发现慢性前列腺炎患者常合并有前列腺结石，而对后者进行结晶分析发现前列腺结石是由尿液成分组成而非前列腺分泌物，这提示慢性前列腺炎患者存在尿液返流的可能。陆续开展尿液返流研究已基本证实慢性前列腺炎存在着不同程度的尿液返流机制。Kirby将炭末悬液在前列腺切除前注入膀胱，次日在切除的前列腺中发现炭末，这强有力的证实存在尿液返流机制。由于前列腺外周区域的腺管粗且侧对着尿流方向，甚至以直角进入尿道，这一解剖学特征是发生尿液返流的基础。尿液返流至前列腺腺管内可引起化学性前列腺炎，同时也易将病原体带入前列腺内，继发细菌性前列腺炎。尿液返流的机制可能与慢性前列腺炎引起的功能性尿路梗阻所致的后尿道高压相关。因为慢性前列腺炎患者多伴自主功能紊乱，致α 肾上腺受体兴奋性增高，以及感染刺激括约肌神经，从而导致或加重后尿道神经肌肉功能失调，膀胱颈部功能紊乱和骨盆肌群痉挛，使排尿时前列腺部尿道压力增大，导致尿液返流或加重慢性前列腺炎。
4 自身免疫因素
在慢性非细菌性前列腺炎发病中，支原体、衣原体等虽是常见的微生物，但有学者认为微生物感染可能不是重要的致病因素，因为正常人尿道中也可见到这些微生物。近年来有人对感染与症状之间的关系提出疑问，因为在无症状性前列腺炎患者前列腺液内发现局部细菌数量并不少于甚至超过慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS患者。此外，排除技术性原因外，相当一部分有症状的慢性前列腺炎患者却检查不到病原体的存在。因此，近年来慢性前列腺炎的免疫学研究越来越受到关注。
5 遗传易感性因素
据流行病学研究发现，23%的慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS病人其一级男性家属中也患有慢性前列腺炎。因此逐渐开展了慢性前列腺炎的基因表达研究。现已初步认为慢性前列腺炎有一定的遗传易感性。Riley分析了120例慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS患者和300例正常人的磷酸甘油激酶基因旁的短串联重复序列(STR)的多态性。在Xq11 13染色体区的磷酸甘油激酶基因旁有高度多态性的STR，而该STR存在于已知与前列腺疾病易感性相关的DNA区域。他对9个不同等位基因进行检测发现，所有慢性前列腺炎PS患者的等位基因分布不同于对照组，这表明Xq11 13可能含有使患者易感慢性前列腺炎PS的遗传位点。Shoskes研究了慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS患者遗传基因的多态性与细胞因子基因表达的关系。他对慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS组与对照组进行基因组DNA比较，发现两组在TNF α、TGF β、IL 6等位基因的表达频率上无明显差异，然而慢性前列腺炎/慢性前列腺炎PS组患者更倾向于IL 10基因的低表达。但亦有人认为细胞因子的基因多态性有一定的局限性，也许对某个体来说即使是某种细胞因子的低表达型基因，但在某些刺激因素作用下也会大量产生该细胞因子。
6 自主神经功能失调及精神心理因素
慢性前列腺炎患者常有性欲减退、早泄、阳痿等一系列性功能障碍。这些自主神经功能紊乱表现可致α 肾上腺素受体兴奋性增高，从而导致或加重膀胱及后尿道神经肌肉功能障碍、植物神经功能紊乱，进而使排尿时前列腺部尿道压力增大，尿液返流入前列腺而致病。后尿道神经肌肉功能障碍还使尿道闭合压升高，引起会阴部疼痛，是前列腺痛的重要原因，而疼痛又加重患者的情绪反应，造成恶性循环。长期精神上的不良刺激也会带来细胞和分子水平上的一系列改变。有研究发现除了引起许多如细胞因子、细菌毒素、缺氧等改变外，还会使肥大细胞释放其内容物，加重炎症及免疫反应。
7 其他发病因素
慢性前列腺炎患者大多能在其前列腺液中发现白细胞的增多，以及能检测到一些炎症介质的异常。因此，以往认为慢性前列腺炎是一种非特异性的炎症过程。近年来，有人提出前列腺炎引起的疼痛可能是有外周及中枢神经系统的炎症所致。Ishigooka发现对小鼠前列腺及膀胱进行化学刺激会引起L5 S1脊髓c fos的表达，同时引起相应皮肤传入神经纤维分布区的血浆外渗，这一特点说明了这种改变是神经性炎症的结果。这一理论能解释部分患者症状产生的机理，但究竟在慢性前列腺炎发病中占具多大作用尚需进一步研究。此外，还有人提出慢性前列腺炎症状可能与间质性膀胱炎相关。因为发现两者有相同的病理生理过程，都表现为下尿路上皮细胞功能障碍。Parsons认为男性前列腺炎患者及女性间质性膀胱炎患者他们的症状的产生不是由各自独立的疾病引起，而是由存在于整个下尿路的上皮细胞功能障碍及钾循环引起。总之，慢性前列腺炎病因及发病机制复杂，尽管上述几种主要因素均能导致此病的发生，但并不是孤立的，往往在其发病中互相渗透，互相联系。Pontari总结了MEDLINE上1966年至2003关于慢性前列腺炎的文献，认为其发病是感染、免疫、内分泌、神经、精神因素等相互作用的结果。不同的慢性前列腺炎患者，病原体感染情况、自身免疫、遗传背景及神经、精神因素等都不一样，其发生、发展变化可能是某种因素主导的结果，也有可能是众多因素的综合作用结果。也正因为这种复杂性，综合研究其病因能使我们更深刻地理解慢性前列腺炎，提高临床治疗水平。
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